⚠️ 重要通知: 本仓库不再维护。请访问SCMCPHub获取最新版本的MCP服务器。

SCMCP

用于scRNA-Seq分析的自然语言MCP服务器。

🪩 它能做什么？

• 输入输出模块，如使用自然语言读取和写入scRNA-Seq数据
• 预处理模块，如过滤、质量控制、标准化、缩放、高变基因、PCA、邻居关系等
• 工具模块，如聚类、差异表达等
• 绘图模块，如小提琴图、热图、点图
• 细胞间通讯分析

❓ 这适用于谁？

• 任何想要使用自然语言进行scRNA-Seq分析的人
• 想要调用scanpy函数为其应用程序服务的代理开发者

🌐 在哪里使用它？

您可以在大多数支持MCP的AI客户端、插件或代理框架中使用scmcp：

• AI客户端，如Cherry Studio
• 插件，如Cline
• 代理框架，如Agno

🎬 示例

一个演示在AI客户端Cherry Studio中使用基于scmcp的自然语言进行scRNA-Seq细胞聚类分析的示例

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ 快速开始

安装

从PyPI安装

pip install scmcp

您可以运行以下命令进行测试

scmcp run

在本地运行scnapy-server

参考以下配置在您的MCP客户端中：

"mcpServers": {
  "scmcp": {
    "command": "scmcp",
    "args": [
      "run"
    ]
  }
}

在远程运行scnapy-server

参考以下配置在您的MCP客户端中：

在您的服务器上运行

scmcp run --transport sse --port 8000

然后配置您的MCP客户端，如下所示：

http://localhost:8000/sse

🤝 贡献

如果您有任何问题，欢迎提交issue，或联系我(hsh-me@outlook.com)。我们也欢迎对代码的贡献！